在破桉的过程中因为少年侦探团的捣乱，让柯南陷入了险境。要不是灰原哀拿起手枪射击，少年侦探团就真的要团灭了。
少年侦探团再次给柯南制造了比黑衣组织更危险的局面。黑衣组织虽然强大，但他们可怕的是犯罪计划，但只要有计划，柯南就有把握抽丝剥茧。
而少年侦探团的可怕在于不可测，根本不知道这几个熊孩子会干什么，就算是大侦探也无可奈何，也会因为不可控因素而措手不及。
组织的阴谋计划虽然可怕，虽然破坏性十足，但只要有计划就有破绽，加上柯南还有fbi、公安、军情六处的队友协助，也不怕这些阴谋诡计。
但对少年侦探团的不可测性，柯南总是从主动掉入被动，总是无可奈何地陷入危险。
这次真的是要多谢灰原哀了，她捡起了罪犯的手枪，并且开枪为柯南解围，解救了少年侦探团。
通过这件事情，灰原哀也确定了柯南就是工藤新一没跑了。
少年侦探团的家长得知孩子破了一个假钞桉，都很高兴。丝毫不考虑孩子们要是陷入危险怎么办，这次罪犯可是有枪的。
目暮警官都无语了。
柯南决定送灰原回家，却发现这不是朝自己家的方向走么？
“工藤新一，你果然没死。”灰原哀突然开口，把柯南吓了一跳。
“你是谁？”柯南很紧张。
“你不用担心，有件事情我要告诉你。那就是关于阿笠博士的，他是黑衣组织的人，我想他从很久以前就一直在关注你这个警视厅的救世主了。”灰原说这些没有证据，只有直觉。但她相信自己的直觉，只要黑衣组织成员接近自己，她的直觉雷达肯定会做出反应，百试百灵。
所以她确定阿笠博士肯定也是组织的人。
“不可能。”他们和阿笠博士做了几十年邻居，说道：“他是看着我长大的，不可能是组织的人。”
“以前或许不是，但组织神通广大，可以杀死博士取而代之。”灰原冷冷地说道：“你难道没察觉博士变了么？”
柯南沉默了，确实变了很多，以前博士一直穿白衣服，现在换成了黑色。而且以前的博士也是法派的支持者，现在却总是说一些非法派的言论，变化不少。
难道阿笠博士真的被害死了，现在的博士是假的？
“可是如果这个博士是假的，他知道我是工藤新一，为什么不出手？”柯南问道。
“或许是要观察你这个实验对象吧。本来我认为只有我一个人知道你还活着，看来我太小看组织了。”灰原哀说道。
“所以你到底是谁？”
“我叫做宫野志保，是组织的研究员，你吃下的药剂就是我改良的。在发现你的秘密之后，我也吃下了药，从组织逃了出来。”
柯南明白了对方是组织的叛徒，吃了药，返老还童了。那么她说的话就有一定的可信度了，难道博士真的已经被取而代之了？想到这里，他是彻底不好了，得想办法确定博士的身份。同时他感觉很无奈，因为身边的人总是出事。
