以上是南明政府的五大常委（大学士）。
同时，改任原都察院右都御使张慎言为吏部尚书，主管组织，人事工作。吏部尚书官方又称“冢宰”，民间俗称“天官”，
改兵部左侍郎吕大器为吏部左侍郎，
起用赋闲在家的儒学大师刘宗周老先生担任都察院左都御史，
升御史祁彪佳为大理寺丞，右佥都御使，巡抚苏松（苏州府和松江府），
升太常卿左懋第为右佥都御史，巡抚应安（应天府和安庆府）
升吏科给事中李沾为太常寺少卿，提督四夷馆。四夷馆是明朝为培养翻译人才而专门设立的教育机构。
……弘光帝朱由崧不是一个爱记仇的人，更非睚眦必报。
他了解东林党人与其祖母郑贵妃，父亲老福王的过节，也知道有很多人开初并不支持自己当皇帝，但朱由崧很看得开，他的态度是“无所谓”，因为事情已经过去了，纠缠于过去恩怨的人，是不会有出息的。
朱由崧艺术修养颇高，过去在洛阳无所事事，最爱听曲看戏，有一首歌曲其实很能代表他的心：“无所谓，无所谓，原谅这世界所有的不对，何必让自己痛苦的轮回，放过了自己才能高飞，无所谓，我真的无所谓。”
南明政府内阁里的五大常委，有两位是正牌的东林党人史可法和姜曰广。高弘图与王铎则属温和派，一个正直能干，本身倾向于东林派的观点，一个则文采风流，书画一流，对政治不怎么感兴趣。
其他几个重要职位，也都给与了东林党人和他们的同情者，如六部中最重要的吏部，部长一职交给了年高望重的张慎言，都察院左都御史（总检察长）一职则授予东林党老前辈刘宗周。
在国家一把手朱由崧的支持下，史可法，高弘图，张慎言等人为了建成一届得民心，讲正气，有威信的领导班子，确定的中央政府各个重要职位的任职标准只有两条：声望和资格。
用史书上的话说：“南都初建，众正盈朝，其六卿之长，皆民誉也。”在社会上没有好口碑的人，是进不了南京政府部委班子的。
……对于力挺自己登基称帝的人，朱由崧当然也不会忘记。
总兵官高杰赐爵兴平伯，
总兵官刘良佐赐爵广昌伯，
总兵官刘泽清赐爵东平伯，
总兵官黄得功由靖南伯晋升为靖南侯，
另外，在长江上游镇守武昌的宁南伯左良玉也晋升为宁南侯。
在朱由崧眼里，这五个人就是南明政府的五虎上将，相当于三国时期刘备手下的关张赵马黄。
至于拥戴朱由崧称帝有功的两位内臣韩赞周和卢九德，一个被任命为司礼监秉笔太监，一个被任命为提督京营太监。
那位在雪地里背着朱由崧狂奔了几十里路的救命恩人常应俊，从此也不再研究皮革技艺，被破格提拔为左都督，不久又赐封项城伯。
